Monday, May 04, 2009

A(H1N1) VIRUS and MATH MODELS



New scientist, abstract)
In a previous post, we postulated the necessity to begin to generate viral vaccine virtual models, using mathematical models that compares viral genomic changes (of the current A-H1N1- and of the H1N1/1918), relating them with their corresponding structural antigenic changes. Now: Nicholas Grassly of the Imperial College/London and Andrew Rambaut/University of Edinburgh/UK, have just completed the first mathematical model of the severity of the virus A(H1N1), keeping in mind small mutations accumulated in 2 dozens of genetic sequences of the virus A(H1N1), gathered from patients of Mexico and USA.

With it, the variable Ro was calculated. If Ro, is smaller than 1, the infection is light and will disappear quickly. The Ro of the current virus A(H1N1), is 1.16 (low severity). The viral pandemic H1N1/1918, had a Ro of 1.45, initially. Later in their lethal phase (second wave), a Ro : 3.75 was reached. Of another side, the number of accumulated mutations, has allowed to calculate that the virus mutated to its current conformation in September/2008 or January/2009. Diverse data of the virus A(H1N1) and others, are available free in internet (GISAID/2006).
MODELOS MATEMATICOS y VIRUS (A(H1N1)

En un post nuestro, publicado hace menos de una semana, postulábamos la necesidad de empezar a generar modelos virtuales de vacunas, empleando modelos matemáticos que comparasen cambios genómicos virales (del actual A-H1N1- y del H1N1 de 1918), relacionándolos con sus correspondientes cambios estructurales antigénicos. Ahora:
Nicholas Grassly del Imperial College/London y Andrew Rambaut/University of Edinburgh/UK, acaban de completar el primer modelo matemático de potencia (letal/no letal), del virus A(H1N1), teniendo en cuenta pequeñas mutaciones acumuladas en 2 docenas de secuencias genéticas del virus A(H1N1), recolectado de pacientes de México y USA.

Con ello, han calculado la variable Ro. Si el Ro, es menor que 1, la infección es leve y desaparecerá rápidamente. El Ro del virus A(H1N1) actual es 1.16 (baja potencia). La pandemia viral H1N1 de 1918, tuvoun Ro de 1.45, inicialmente. Más tarde en su fase letal (segunda ola), alcanzó un Ro de 3.75. De otro lado, el número de mutaciones acumuladas, ha permitido calcular que el virus mutó a su actual conformación en Septiembre/2008 o Enero/2009. Diversos datos del virus A(H1N1) y otros, están disponibles gratuitamente en internet (GISAID/2006).

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